MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI05

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021497	A	6	6	3173	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021497	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021497	CTT	2	6	4586	4591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021497	ATTG	2	8	4610	4617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021497	T	6	6	4645	4650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021497	A	7	7	4655	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021497	T	7	7	4704	4710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021497	TTAT	2	8	4719	4726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021497	C	6	6	4778	4783	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_021497	GATA	2	8	4878	4885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021497	AT	3	6	4886	4891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021497	TATT	2	8	4912	4919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021497	ATA	2	6	5369	5374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021497	AG	3	6	5389	5394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021497	TC	3	6	8172	8177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021497	AGTT	2	8	8773	8780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021497	T	6	6	9931	9936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021497	AT	3	6	9946	9951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021497	TA	3	6	9952	9957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021497	TA	3	6	10940	10945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021497	ATA	2	6	10950	10955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021497	ATA	2	6	10965	10970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021497	TAT	2	6	10973	10978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021497	TA	3	6	10983	10988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021497	ATT	2	6	11056	11061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021497	ATA	2	6	11082	11087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021497	G	6	6	11136	11141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021497	A	6	6	11150	11155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021497	TGT	2	6	11181	11186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021497	TTAT	2	8	13332	13339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021497	TA	3	6	13361	13366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021497	GTA	2	6	13406	13411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021497	TCG	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021497	T	9	9	13515	13523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021497	C	6	6	13536	13541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_021497	C	6	6	13558	13563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_021497	T	7	7	13585	13591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021497	GGATA	2	10	13599	13608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021497	GGATA	2	10	13643	13652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021497	C	6	6	13671	13676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_021497	T	7	7	13677	13683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021497	ATG	2	6	13725	13730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021497	T	6	6	13786	13791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021497	GTCC	2	8	13819	13826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021497	A	7	7	13923	13929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021497	TGAC	2	8	13931	13938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021497	AAT	2	6	13944	13949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021497	GTCA	2	8	13960	13967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021497	AGG	2	6	14036	14041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.